马犬45天龄时就可以注射疫苗。第一年的注射需要连续注射3次，每次间隔约为20-21天。马犬至少三个月大才可以接种狂犬病疫苗。疫苗一般有2联、4联、6联、8联、狂犬病疫苗等。2联通常是针对犬瘟和犬细小。4联对犬瘟、犬细小、犬传染性肝炎、犬副流感和犬II型腺病毒。6联在4联的基础上有钩端螺旋体。8联在6联的基础上加入了冠状病毒的抗体。2联中的犬瘟，犬细小抗体比其他疫苗多10倍以上。疫苗注射后3天内，口服抗生素、驱虫药等药物可能会导致免疫失败。一周内，马犬的体内产生抗体，抵抗力下降，不能给马犬洗澡，引起呼吸系统疾病可能会导致疫苗注射失败，在此期间不要出去遛狗，防止感染。体质比较差，营养不良的马犬，最好先改善体质，加强营养，直到身体健康后再接种疫苗。
