主要可以通过猫咪的生殖器进行辨别。一般来说公猫会在肛门下方有一个睾丸，但是母猫没有睾丸。母猫肛门下方则是阴道和尿道的开口，不过小于四月龄的公猫睾丸可能还没有从体内调到阴囊中。
如果猫咪肛门下方是一条线就是母猫，如果是一个圆柱状就是公猫。

辨别猫性别最准确的方法是观察猫的生殖器，因为幼猫时期很难分辨是公猫还是母猫，这时候公猫的睾丸没有外露，而且还在腹腔内，所以很难用肉眼判断是公猫还是母猫。2~5个月后睾丸下垂，可以正确判断性别。看生殖部位的形态是比较可靠的方法。母猫的肛门与生殖器之间的距离比公猫近，肛门下1厘米处有垂直阴道口，尿道在阴道口中。公猫的肛门和生殖器之间的距离远于母猫，肛门下有睾丸和阴茎。睾丸在2~5个月后明显变大。绝育的雄猫还是会阴囊，虽然一般比较小。

一般来说，4月龄以上的猫最好通过外生殖器的不同来区分。超过4月龄的公猫在肛门下包裹着阴囊的睾丸和阴茎，母猫在肛门下垂直于地面开口的阴门。小于4月龄的公猫可能睾丸没有掉进阴囊里。否则也可以用阴茎包皮和阴门开口来区分猫的公母。此外还可以用超声波区分。