主要可以通过猫咪的生殖器进行辨别。一般来说公猫会在肛门下方有一个睾丸，但是母猫没有睾丸。母猫肛门下方则是阴道和尿道的开口，不过小于四月龄的公猫睾丸可能还没有从体内调到阴囊中。如果猫咪肛门下方是一条线就是母猫，如果是一个圆柱状就是公猫。
可以用以下方法确定猫的性别。首先，小猫没有达到性成熟，不能从猫有没有睾丸来判断，主人可以从猫的肛门和生殖器的距离来判断。母猫的肛门和生殖器之间的距离很近，公猫的肛门和生殖器之间的距离很远。其次，可以从生殖器的形状来判断。公猫比较圆，母猫呈线状。
一般来说，4月龄以上的猫最好通过外生殖器的不同来区分。超过4月龄的公猫在肛门下包裹着阴囊的睾丸和阴茎，母猫在肛门下垂直于地面开口的阴门。小于4月龄的公猫可能睾丸没有掉进阴囊里。否则也可以用阴茎包皮和阴门开口来区分猫的公母。此外还可以用超声波区分。
